Желудочный сок содержит соляную кислоту (HCl) в концентрации около 0,5%, что создаёт сильнокислую среду (pH 1,5-2,0). Эта среда выполняет несколько важнейших функций: активирует фермент пепсин, который расщепляет белки; вызывает денатурацию (разбухание) белков, делая их более доступными для ферментов; а также обладает мощным бактерицидным действием, убивая большинство микроорганизмов, попадающих в желудок с пищей.