Кукушкин лен относится к листостебельным мхам, у которых отсутствуют истинные корни и специализированная проводящая система. Всасывание воды и растворенных минеральных веществ происходит всей поверхностью тела, а удержание на субстрате осуществляется с помощью тонких нитевидных выростов стебля — ризоидов.